Micro CT扫描仪对工艺品的修复工作十分有帮助，例如名家画作的修复。可将画作放置在光谱仪前面后，高倍相机（具有固定焦点）的图像将帮助对准光谱仪，与画作保持合适的距离。低倍相机扫描感兴趣图像上的整个区域，并由图像软件创建一幅拼接的概览图像。由于扫描是由高精度的机械装置完成的，而低倍相机的光学系统决定视场，所以可以将概览图像的每个像素与光谱仪坐标系中的一个位置相关联。这意味着，用户只需在系统用户界面上单击概览图像，即可将高倍相机图像的中心移动到任何位置，以便近距离查看细微特征，或将聚焦的X射线点移动到任何位置进行光谱分析。

　　通过选择特定的元素，史学家可以分析画作中个别颜料的位置。这可以揭示出画作的修改痕迹，即时间的推移画作中发生的改变或是增加了什么元素。例如画作不同层次上颜料使用量的差异，可能表明有不同的画家参与了同一幅作品的创作。

　　此外，Micro CT扫描仪也可以用于地平线样本分析，如岩芯分析，以检查地质历史、岩石和沉积物序列，以及古气候的发展等等。